Antikor Mühendisliği
Baş Araştırmacı: Dr. Sibel KALYONCU
Dr. Sibel Kalyoncu Uzunlar, Georgia Institute of Technology’de doktora eğitimini tamamlamıştır ve 2018 yılından itibaren İzmir Biyotıp ve Genom Merkezi’nde araştırma grup lideri olarak görev yapmaktadır. Uzmanlık alanları arasında antikor mühendisliği, yönlendirilmiş evrim, biyofarmasötik ve aşı üretim süreçleri yer almaktadır. Hem akademik hem de özel sektör iş birlikleri kapsamında, tedavi ve tanı amaçlı ileri düzey biyoteknolojik ürünler geliştirmektedir. Yönettiği projelerde mikrobiyal ve memeli ekspresyon sistemlerini kullanarak yeni nesil antikor ve aşı adayları üretmektedir. TÜBİTAK, TUSEB ve COST destekli çok sayıda proje yürütmekte ve özel sektör projelerinde bilimsel danışmanlık yapmaktadır. BAGEP ve L'Oréal-UNESCO gibi prestijli ödüllere layık görülmüştür.
Araştırma Alanları
Antikor Keşfi
Antikor Mühendisliği ve Tasarımı
Rekombinant Protein Ekspresyon Sistemleri
Biyofarmasötik Geliştirme
Rekombinant Aşı Geliştirme
Akılcı İlaç Tasarımı
Oftalmolojik Biyoterapötikler
Antimikrobiyal Peptitler
Yapısal Biyoloji ve Protein Biyofiziği
Yayınlar
Kalyoncu, S.*, Sayili, D., Kuyucu, A.Z., Soyturk, H., Gullu, S., Ersayan, B., Tarman, I.O., Avci, M.E., Mert, O., Haskok, U., Tekin, E., Akinturk, H., Orkut, R., Demirtas, A., Tilmensagir, I., Ulker, C., Gungor, B. and Inan, M. (2025), Development of a Recombinant Omicron BA.1 Subunit Vaccine Candidate in Pichia pastoris. Microb. Biotechnol., 18: e70077.
Yuceer, S., Yalcin, H.T., Kalyoncu, S.* (2025) Engineering of antimicrobial peptides by surface display technologies. Advances in Protein Chemistry and Structural Biology: Academic Press.
Kuyucu, A.Z., Sayili ,D., Orkut, R., Mert, O., Tarman, İ.O., Lulaci, B., Sencer ,A.M., Kurden-Pekmezci, A., Avci, M.E., Kalyoncu, S.*, Inan, M. (2024) Cell line development and bioreactor process optimization for an atezolizumab biosimilar. Biotechnol Appl Biochem. 2024; 1–14.
Arslan, M., Uluçay, T., Kale, S., Kalyoncu, S.* (2023). “Engineering of conserved residues near antibody heavy chain complementary determining region 3 (HCDR3) improves both affinity and stability.” Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - Proteins and Proteomics 1871(4).
Kalyoncu, S., et al. (2023). “Process development for an effective COVID-19 vaccine candidate harboring recombinant SARS-CoV-2 delta plus receptor binding domain produced by Pichia pastoris.” Scientific Reports 13: 5224.
Proje ve Patentler
Terapötik anti-PD-1 nanohibritlerin geliştirilmesi, in silico optimizasyonu, üretimi ve in vivo/in vitro karakterizasyonu
Destekleyen Kurum: TUSEB
Yaşa Bağlı Makula Dejenerasyonu için Özgün Biyoteknolojik İlaç Geliştirilmesi
Destekleyen Kurum: TÜBİTAK TEYDEB
Epinecidin-1’in Maya Yüzey Teşhir Sistemi ile Akılcı Tasarımı
Destekleyen Kurum: TUSEB
Nrf2 Aktivite Ölçümü için SIMOA Tabanlı Kit Geliştirilmesi
Destekleyen Kurum: TÜBİTAK COST
PAN-TER: Hedefe Yönelik Pan-Kanser Tedavileri
Destekleyen Kurum: TÜBİTAK 1004
Ekip
Aktif Üyeler
Merve Aydoğan (Doktora öğrencisi)
Ali Mert Sencer (Doktora öğrencisi)
Smyrna Ergönül (Yüksek Lisans öğrencisi)
Önceki Üyeler
Merve Aydoğan (Doktora öğrencisi)
Eda Eskier (Doktora Öğrencisi)
Murat Karadağ (Doktora Öğrencisi)
Şuğra Yüceer (Yüksek Lisans Öğrencisi)
Saniye Gül Kaya (Yüksek Lisans Öğrencisi)
Dilara İtik (Araştırmacı)
Ayşe Argündoğan (Lisans Öğrencisi)
