Araştırmadan servise: Biyoinformatik destek birimlerinin planlanması ve yönetimi” konulu EMBO uygulamalı kursuna İBG’de ev sahipliği yaptık

EMBO uygulamalı kursunda, yeni biyoinformatik destek birimi (ing. “core facility”) yöneticilerine, deneyimli yöneticiler tarafından, planlama, kaynak bulma, işletme ve etki değerlendirmesi konularında eğitim verildi.

Beş gün süren kursta, biyoinformatik destek birimi yönetimi sırasında karşılaşılan zorlukların farklı yönleri tartışıldı. Düzenlediğimiz EMBO kursunun benzersiz özelliklerinden biri, kursta tartışılan konuların aktif olarak kurs içeriğine yansıtılması oldu. Başka bir ayrıştırıcı nokta ise katılımcılarla eğitmenlerin pratik alıştırmalara birlikte dahil olmasıydı. Bu şekilde katılımcı ve eğitmenlerin birbirlerinin deneyimlerinden faydalanması teşvik edilmiş oldu.

Katılımcı ve eğitmenler İBG’nin önünde

1.Gün: Destek birimi yönetimine giriş, fırsatlar ve zorluklar

Kursun ilk günü Ezgi Karaca’nın (İBG) kursun nasıl ilerleyeceğini anlattığı bir sunum ile başladı. Gün, onur konuğu Alexandre Bonvin’in (Utrecht Universitesi) sunumu ile devam etti. Alexandre, araştırma ve servis (özellikle AB e-Altyapı) faaliyetlerini eşzamanlı yürütme konusundaki kapsamlı deneyimlerini katılımcılar ile paylaştı. Alexandre’ın araştırma ile servis arasında nasıl denge kurduğu ile ilgili verdiği örnekler, katılımcılara yeni bir bakış açısı kazandırdı.

Alexandre Bonvin’in konuşması: “Biyoinformatikte, araştırmayı ve servisi dengelemenin yolları”

Açılış konuşmasından sonra, Revathi Nathaniel (EMBL-EBI) katılımcılara biyoinformatik destek birimi yönetmede yaşanan zorlukların ve problemlerin nasıl tanımlanacağı konusunda yol gösterdi. Bu oturumda gündeme gelen güncel problemler beş ana başlık altında toplandı. Her bir başlık kurs boyunca eğitim odalarına yerleştirdiğimiz panolarda sergilendi. Her kurs günün sonunda ise hangi maddelerin üzerinden geçildiği tartışıldı.

Kursta tartışılan beş ana başlığın sergilendiği panolar

2.Gün: Biyoinformatik servis biriminin tasarımı ve kurulması: İhtiyaçlar

İkinci gün Geoge Bell’in (Whitehead Institute), biyoinformatik destek birimi yürütme deneyimlerini paylaştığı bir sunumla başladı. George, kendisinin “araştırmacıları güçlendirmek” olarak tanımladığı liderlik görevini Whitehead Enstitüsü’ndeki biyoinformatik destek takımında nasıl uyguladığını anlattı. George’ın oturumu katılımcıların gelecekte kuracakları veya mevcut tesislerinin üzerine düşünmelerini hedefleyen 25 soru ile bitti.

George Bell, Whitehead Enstitüsü’ndeki grubunu tanıtıyor

George’un oturumunun ardından, Revathi ve Vera, kurs grubunun farklı ekiplere bölündüğü eğlenceli ve dinamik bir oturum düzenlediler. Bu oturum sonucuna, her ekibin aynı probleme farklı çözümler getirdiği görüldü ve servis tasarlamanın ne kadar zor olduğu tüm katılımcılar tarafından kavrandı. Bu günümüz, Cath'in yönettiği ve katılımcıların birimlerinin etkilerini tartıştığı, teşvik edici bir oturumla sonlandı.

3.Gün: Biyoinformatik destek birimi işletmek

Üçüncü gün, İBG'den (Serap Erkek) küçük ölçekli bir hesaplama örneği ve FMI'dan (Michael Stadler) büyük ölçekli bir hesaplama örneği olmak üzere iki farklı biyoinformatik destek birimi üzerine durdu. Serap ve Michael ayrıca, kurumlarında üretilen dijital verilerin farklı kullanım alanları, iş akışları ve ihtiyaçlarından bahsetti.

Serap Erkek ve Micheal Stadler biyoinformatik destek birimlerini tanıtıyor

Bu oturumdan sonra, Yasemin Türkyılmaz, katılımcılara biyo-verilerin sürdürülebilir şekilde yönetilmesine dair kullanışlı ipuçları ve püf noktaları sundu. Yine bu alanda kapsamlı tecrübesi olan Brent Richter (Partners HealthCare) hassas verilerle nasıl çalışılacağını katılımcılarla paylaştı. Brent konuşmasında özellikle veri gizliliği ve güvenliğine odaklandı. Veri şifreleme, veri paylaşma ve saklama protokollerinin önemini vurguladı. Brent ayrıca, gelecekteki bilgi alışverişi faaliyetlerinde bir platform olarak hizmet edebilecek küresel Bioinfo-Core grubunu sundu.

Brent Richter küresel “Bioinfo-Core” grubunu tartışıyor

Brent’in konuşmasının ardından Emre Karakoç (Wellcome Sanger Institute), Afrika genom birliği çalışmasında hassas verilerin nasıl ele alındığını tartıştı. Emre, hasta / müşteri verilerinin kontrolünde blok zincirlerinin nasıl faydalı hale getirilebileceğini anlattı. Üçüncü gün, Cath ve Brent’in katkısı ile, yöneticilerin çalışanlarının yetkinliklerini nasıl tanımlayabilecekleri ve bir çalışanı işe nelere dikkat edilmesi gerektiği konularının tartışılması ile sona erdi.

4. Gün: Biyoinformatik destek biriminin finansal altyapısının oluşturulması

Sarah Butcher (EMBL-EBI), f-kelime diye tanımladığı “fonlama ve finans” alanındaki farklı deneyimlerini paylaştı. Sarah, çalışan ve hizmetlerin nasıl maliyetlendirileceğini kapsamlı bir şekilde açıkladı. Daha sonra Vera, nerede olduğun ve nerede olmak istediğin arasındaki yol olarak tanımladığı proje yönetimi hakkında kısa bir eğitim verdi. Dördüncü günde dersler, değişim teorisi (projenin beklenen sonucunun proje süresince sürekli olarak güncellenmes) üzerine pratik bir çalışma ile son buldu. Dördüncü gün, tarihi ve büyüleyici Celcus Kütüphanesi’nde tamamlandı.

Celsus Kütüphanesi-Efes’teyiz!

5.Gün: Kullanıcıları Destekleme

Cath ve Vera, destek birimi kullanıcılarının eğitimi için hizmet tasarımı ve yetkinlik kavramları üzerinde kapsamlı bir şekilde durdu. Bu ders sonucunda katılımcılar, etkili bir eğitiminin nasıl olması gerektiğini, kullanıcı geri bildirimlerinin nasıl toplanacağını ve bir eğitim programının etkisinin nasıl ölçülmesi gerektiğini öğrendiler. Daha sonra ilk gün belirlenen konulardan “üzerinden geçilmemiş” olanlar (bilişim teknolojileri yönetimi, zaman yönetimi) tekrar gündeme getirildi ve tartışıldı.

Cath Brooksbank bilişim teknolojileri-karar şemasını açıklıyor.

Kursumuz geri bildirim (Revathi), kapanış konuşması (Ezgi) ve büyük bir alkış ile sonlandı!

Hoşcakal deme zamanı: Birlikte son otobüs yolculuğu

Daha fazla fotoğraf ve içerik için, Twitter’da #EMBObioinfocore ile arama yapabilir veya kursumuzun sitesini ziyaret edebilirsiniz http:/meetings.embo.org/event/19-bioinformatics-core.

Hazırlayanlar: Ezgi Karaca, Cath Brooksbank
Türkçeleştiren: Tülay Karakulak