Histopatoloji Birimi

Histopatoloji Birimi, doku düzeyinde gerçekleştirilen morfolojik incelemeler aracılığıyla temel, translasyonel ve klinik araştırmalara nitelikli destek sağlayan önemli bir araştırma altyapısıdır. Birimimiz, ileri düzey doku işleme ve analiz ekipmanlarıyla araştırmacılara güvenilir, hızlı ve yüksek kaliteli histopatolojik değerlendirme olanakları sunmaktadır.

Histopatolojik analizler; hastalık mekanizmalarının aydınlatılması, ilaç adaylarının etkinlik ve toksisite değerlendirmeleri, biyobelirteçlerin doğrulanması ve doku düzeyinde patolojik değişimlerin karakterizasyonu gibi birçok araştırma alanında kritik rol oynamaktadır. Bu doğrultuda birimimiz, rutin Hematoksilen–Eozin (H&E) boyamaları ile birlikte PAS, Masson’s Trichrome gibi özel histokimyasal boyama protokollerini uygulayabilmektedir.

Sunulan hizmetler yalnızca kurum içi araştırmacılarla sınırlı olmayıp; kurum dışı ve özel sektör kaynaklı talepler de aynı süre ve titizlikle karşılanmaktadır.

Cihaz ve Ekipmanlar

• Otomatik doku takip cihazı
• Parafin doku gömme sistemi
• Mikrotom kesit sistemi
• Doku boyama ve kaplama otomasyon sistemleri
• Trinoküler BX53 ışık mikroskobu ve mikrofotoğrafi sistemleri
• Kriyostat kesit sistemi
• Histopatoloji raporlama altyapısı
• Sitosantrifüj

Katkı Sağladığımız Yayınlar

1. Koc AC, Sari V, Kocak G, Recber T, Nemutlu E, Aberdam D, Güven S, Patient-derived cornea organoid model to study metabolomic characterization of rare disease: aniridia-associated keratopathy, BMC Ophthalmol 25, 14 (2025). https://doi.org/10.1186/s12886-024-03831-w
2. Kahveci B, Polatli E, Bastanlar Y, Guven S, OrganoLabeler: A Quick and Accurate Annotation Tool for Organoid Images, ACS Omega 2024, 9, 46, 46117–46128
3. Koçak G, Uyulgan S, Polatlı E, Sarı V, Kahveci B, Bursali A, Binokay L, Reçber T, Nemutlu E, Mardinoğlu A, Karakülah G, Utine CA, Güven S. Generation of Anterior Segment of the Eye Cells from hiPSCs in Microfluidic Platforms. Advanced Biology May;8(5):e2400018. doi: 10.1002/adbi.202400018. 2024
4. Asal M, Kocak G, Sari V, Recber T, Nemutlu E, Utine CA, Guven S, Development of lacrimal gland organoids from human iPSC derived ocular cells, Frontiers in Cell and Developmental Biology 10, 2444, 2023
5. Turker-Burhan, M., Ellidokuz, E.B., Bagriyanik, H.A. and Tozburun, S., “An endoscopic approach providing near-infrared laser-induced coagulation with accurate depth limits,” J. Biophotonics 17:e202300377 (2024).
6. Turker-Burhan, M., Ersoy, N., Bagriyanik, H.A. and Tozburun, S., “Guide mapping for effective superficial photothermal coagulation of the esophagus using computer simulations with ex vivo sheep model validation study,” Lasers Surg Med. 54:1116-1129 (2022).
7. Arlı, B., Dinc, O. F., T ¨ urker-Burhan, M., and Tozburun, S., “Predicting dark-field images of H&E-stained esophageal specimens,” Proc. SPIE 12630, Advances in Microscopic Imaging IV, 1263017 (2023).
8. Turker-Burhan, M., Ersoy, N., Bagriyanik, H. and Tozburun, S., “Optimization study of parameters for laser-induced thermal treatment of the esophageal mucosal layer,” Proc. SPIE 12627, Translational Biophotonics: Diagnostics and Therapeutics III, 1262728 (2023).
9. Turker-Burhan, M., and Tozburun, S., “An endoscopic approach to limit the depth of laser-induced thermal injury,” Proc. SPIE 12627, Translational Biophotonics: Diagnostics and Therapeutics III, 126271W (2023).
10. Turker-Burhan, M., Ba˘ grıyanık, A. and Tozburun, S., “Ex-vivo Model Experimental and Simulation Results Suggesting Effective and Superficial Mucosal Photothermal Ablation at 1505 nm,” European Conferences on Biomedical Optics (ECBO) 2021, OSA Technical Digest. Paper ETh2A.8 (2021).

Birim Sorumlusu: Ece UZUN

Rezervasyon