İBG ARAŞTIRMACILARININ GERÇEKLEŞTİRDİĞİ SARS-CoV-2 GENOM ÇALIŞMASI YAYINLANDI

doi.org/10.1016/j.meegid.2021.104796

Bu çalışma; İBG Nöro-Genomik Laboratuvarı grup lideri Dr. Öğr. Üyesi Yavuz Oktay, İBG Biyoinformatik Platformu’nun lideri Doç. Dr. Gökhan Karakülah , Ege Üniversitesi Biyoistatistik ve Tıp Bilişimi Bölümü'nden Doç. Dr. Aslı Suner, TÜBİTAK destekli post-doktora araştırmalarını İBG'de yürüten Dr. Necla Koçhan ve İBG'de doktora öğrencisi olan Doğa Eskier’in ortaklığında gerçekleşti. Grup daha önce SARS-CoV-2 genomunda en sık gözlenen iki mutasyonun -RdRp geninde 14408C> T ve S geninde 23403A> G- zamanla daha yüksek genom mutasyon yoğunluğu ile doğru ilişkili olduğunu bildirmişti. Araştırmacılar bu çalışmanın devamında yeni sorular sordular ve SARS-CoV-2 genlerinin seçim dinamiklerini ve mutasyon oranlarını, her iki mutasyonu taşıyan ve hiçbirini taşımayan virüs izolatları arasında karşılaştırarak detaylandırdılar.

Virüsün hücrelere girmesi ve kopyalanması için iki anahtar protein olan S ve RdRp’yi kodlayan genler, iki mutasyona da uğramış ve bu iki mutasyona uğramamış virüs genomları arasında en yüksek farklılığı gösterdi. Bu iki genin varyasyon seçim dinamikleri zaman içinde birbirleriyle tezat oluşturdu.

SARS-CoV-2 genomunun ve spesifik genlerinin mutasyon dinamiklerinin ve hızlarının anlaşılması, özellikle aşı ve ilaç çalışmaları virüsün gen ve peptid dizilerine bağlı olduğu için çok önemlidir. Bu çalışma grubundaki tüm araştırmacıları SARS-CoV-2'nin genomik evrimini takip etme ve anlama çabalarından dolayı tebrik ediyoruz.