Organoid Morfoloji Analiz Sistemi Geliştirilmesi için EuroHPC Desteği

Organoidler organların ve sistemlerin üç boyutlu yapılarını taklit ederek onların temel fonksiyonlarını ve biyolojik altyapılarının incelenmesini sağlayan primer veya kök hücre kökenli üç boyutlu yapılardır. Bu yapıları laboratuvarda oluşturmak pahalı ve oldukça zaman alıcı bir süreçtir. Bu sürecin yapay zekâ temelli olarak hızlandırılması ve maliyet tasarrufu sağlanması mümkündür.

Organoidlerin yapay zekâ destekli morfoloji analiz sistemi insan değerlendirmesiyle hataya oldukça açık olan çok miktarda ve heterojen morfolojiye sahip organoid görüntülerini hızlı ve hatasız olarak değerlendirebilecektir. Bu bağlamda Avrupa Yüksek Başarımlı Hesaplama Ortak Girişimi (EuroHPC) tarafından sağlanan GPU desteği ile araştırmacılar yüksek sayıda görüntü içeren organoid analizlerini hızlı bir şekilde yapabilecektir.

Projede Terapötik Biyomühendislik Laboratuvarı üyeleri Doç. Dr. Sinan GÜVEN, Burak KAHVECİ ve BİP Biyoinformatik Platformunun üyeleri Doç. Dr. Gökhan KARAKÜLAH ve Alirıza ARIBAŞ ortaklaşa rol almaktadır.

Çalışmada geliştirilemesi hedeflenen Organoid Morfoloji Analiz Sistemi ile organoidlerdeki deneysel süreçlerin daha hızlı ve insan temelli hataların minimuma indirilerek daha düşük maliyetle yapılması hedeflenmektedir.