Dr. Sanem Tercan Avcı
Biyografi
Dr. Sanem Tercan Avcı, Tıbbi Biyoloji ve Genetik alanında doktora derecesine sahip olup, kanser biyolojisi, epigenetik ve translasyonel biyomedikal araştırma altyapıları alanlarında 15 yılı aşkın araştırma deneyimine sahiptir. Bilimsel kariyeri boyunca temel moleküler kanser araştırmalarını, yüksek kalite standartlarına sahip biyobanka altyapılarının geliştirilmesiyle entegre bir şekilde sürdürmüştür.
2018 yılından bu yana Izmir Biomedicine and Genome Center (IBG)’de Biyobanka Yöneticisi ve Kalite Koordinatörü olarak görev yapmakta; ayrıca BBMRI-Turkey Kalite Koordinatörü olarak ulusal ve Avrupa düzeyinde biyobanka harmonizasyonu ve kalite uyum süreçlerini yürütmektedir. ISO 20387 standardına uyumlu kalite yönetim sistemlerinin kurulması ve akreditasyon süreçlerinin uygulanmasında öncü rol üstlenmiştir. Bu kapsamda, insan biyolojik materyallerinin etik, izlenebilir ve yüksek kalite standartlarında araştırmalarda kullanılmasını destekleyen sürdürülebilir altyapıların güçlendirilmesine katkı sağlamaktadır.
Dr. Tercan Avcı, TÜBİTAK destekli çok sayıda ulusal projede yürütücü ve araştırmacı olarak görev almış; özellikle doku biyobankacılığında preanalitik kalite belirleyicilerinin değerlendirilmesi, immortalize lenfoblastoid hücre hattı biyobankasının geliştirilmesi ve nadir hastalıklar ile nörodejeneratif hastalıklarda multi-omik keşif çalışmalarına odaklanmıştır. Ayrıca IBG-cGMP yürütme ekibinde yer alarak hücre tedavisi üretim altyapılarının geliştirilmesine katkı sunmaktadır.
Bilimsel çalışmalarını eğitim ve kapasite geliştirme faaliyetleriyle destekleyen Dr. Tercan Avcı, uluslararası eğitim okulları ve çalıştayların organizasyonunda aktif rol almakta; biyobanka temelli eğitim modellerinin tıp öğrencileri ve erken kariyer araştırmacılar için yaygınlaştırılmasına katkıda bulunmaktadır.
Araştırma Alanları
Dr. Tercan Avcı’nın bilimsel çalışmaları aşağıdaki alanlarda yoğunlaşmaktadır:
- Hepatik kanser kök hücreleri ve hepatoselüler karsinom
- Tümör progresyonunun epigenetik düzenlenmesi
- Kromatin aracılı transkripsiyonel kontrol mekanizmaları
- Biyolojik örnek kalitesini etkileyen preanalitik değişkenler
- İmmortalize lenfoblastoid hücre hattı biyobankası geliştirilmesi
- Nörodejeneratif ve nadir hastalıklarda çoklu-omik (multi-omics) keşif yaklaşımları
Çalışmaları Cells, Journal of Gastrointestinal Cancer ve Biopreservation and Biobanking gibi hakemli uluslararası dergilerde yayımlanmış olup, hem moleküler araştırmalara hem de teknolojik araştırma altyapı bilimlerine önemli katkılar sunmaktadır.
Biyobankacılık ve Kalite Sistemlerinde Liderlik
Dr. Tercan Avcı, biyobankacılık ve araştırma altyapıları alanında aşağıdaki konularda liderlik rolü üstlenmiştir:
- ISO 20387 standartlarına uyumlu Kalite Yönetim Sistemlerinin kurulumu ve uygulanması
- Biyobanka akreditasyon ve harmonizasyon süreçlerinin yürütülmesi
- Kriyojenik altyapıların ve biyolojik örnek yaşam döngüsü yönetiminin koordinasyonu
- FAIR ilkeleriyle uyumlu veri yönetişimi çerçevelerinin geliştirilmesi
- Çok merkezli ve çoklu-omik araştırma altyapılarının koordinasyonu
Nadir hastalıklar, kanser biyolojisi ve biyobankacılık alanlarında TÜBİTAK destekli ulusal projelerde aktif rol almış; özellikle preanalitik kalite belirleyicilerinin sistematik değerlendirilmesi ve sürdürülebilir biyolojik kaynak koleksiyonlarının oluşturulması konularında önemli katkılar sağlamıştır.
Ayrıca, IBG-cGMP tesisi yönetici ekibinde yer almakta; translasyonel uygulamalar için ürünlerin biyobankalanması konusunda ileri teknoloji platformların geliştirilmesine destek vermektedir.
Yürüttüğü Projeler
Proje Adı: Nadir Hastalıklar için Hücresel Deneysel Modellerin Geliştirilmesi: Ölümsüzleştirilmiş Lenfoblastoid Hücre Hattı Biyobanka Koleksiyonunun Oluşturulması (TÜBİTAK 1005 Proje No: 225S431)
Proje Ekibi: Sanem Tercan-Avci, Çağlar Çelebi, Uğur Özbek, Ahmet Okay Çağlayan, Neşe Atabey
Süre: 18 ay
Başlangıç – Bitiş Tarihleri: 2026 – devam ediyor
Proje Adı: Biyobankacılıkta Doku Örneklerinin Kalitesini Etkileyen Pre-analitik Faktörlerin Analizi (TÜBİTAK 1002 Proje No: 222S754)
Proje Ekibi: Sanem Tercan-Avci, Ceren Ülker, Serap Birincioğlu, Neşe Atabey
Süre: 12 ay
Başlangıç – Bitiş Tarihleri: 15.02.2023 – 14.10.2024
Yayınlar
Tercan-Avcı, S., Çelebi, Ç., Özkalay, B., Özbek, U., & Atabey, N. (2025). Biobanks and Their Contribution to the Field of Rare Diseases: Current Landscape, Challenges, and Future Directions. Inherited Metabolic Disorders and Nutrition, 1(1), 43-52. https://doi.org/10.4274/imdn.galenos.2025.2025-6
Tercan-Avcı, S., Özkalay, B., Celebi, C., Ulker, C., birincioğlu, S., & Atabey, N. (2025). Effect of Ischemia Durations, Transport, Cryopreservation and Storage Conditions on Tissue Integrity, DNA, RNA, Protein Quality and Primary Cell Culture Initiation Capacity in Liver Tissues. JILTI, 3(50), 1-11. https://doi.org/10.14744/jilti.2025.20092.
Karataş M, Azbazdar ME, Camkiranlar M, Tercan-Avci S, Atabey N. Biobank Education for Future Physicians: Training Medical Students Through Student Research Association Networks. Biopreservation and biobanking. 2023 September. https://doi:10.1089/bio.2022.0210.
Korhan P, Tercan-Avcı S, Yılmaz Y, Öztemur Islakoğlu Y, Atabey N. Role of Biobanks for Cancer Research and Precision Medicine in Hepatocellular Carcinoma. J Gastrointest Cancer. 2021 Dec;52(4):1232-1247. doi: 10.1007/s12029-021-00759-y. Epub 2021 Nov 22. PMID: 34807351.
Karagonlar ZF, Akbari S, Karabicici M, Sahin E, Avci ST, Ersoy N, Ates KE, Balli T, Karacicek B, Kaplan KN, Celiker C, Atabey N, Erdal E. A Novel Function for KLF4 in Modulating the De-differentiation of EpCAM-/CD133- nonStem Cells into EpCAM+/CD133+ Liver Cancer Stem Cells in HCC Cell Line HuH7. Cells. 2020 May 12;9(5):1198. doi: 10.3390/cells9051198. PMID: 32408542; PMCID: PMC7290717.
Sengez B, Aygün I, Shehwana H, Toyran N, Tercan Avci S, Konu O, Stemmler MP, Alotaibi H. The Transcription Factor Elf3 Is Essential for a Successful Mesenchymal to Epithelial Transition. Cells. 2019 Aug 9;8(8):858. doi: 10.3390/cells8080858. PMID: 31404945; PMCID: PMC6721682.
Delman M, Avcı ST, Akçok İ, Kanbur T, Erdal E, Çağır A. Antiproliferative activity of (R)-4'-methylklavuzon on hepatocellular carcinoma cells and EpCAM(+)/CD133(+) cancer stem cells via SIRT1 and Exportin-1 (CRM1) inhibition. Eur J Med Chem. 2019 Jul 9;180:224-237. doi: 10.1016/j.ejmech.2019.07.024. PMID: 31306909.
Firtina Karagonlar Z, Koç D, Şahin E, Avci ST, Yilmaz M, Atabey N, Erdal E. Effect of adipocyte-secreted factors on EpCAM+/CD133+ hepatic stem cell population. Biochem Biophys Res Commun. 2016 Jun 3;474(3):482-490. doi: 10.1016/j.bbrc.2016.04.137. Epub 2016 Apr 27. PubMed PMID: 27131739.
Gunes A, Iscan E, Topel H, Avci ST, Gumustekin M, Erdal E, Atabey N. Heparin treatment increases thioredoxin interacting protein expression in hepatocellular carcinoma cells. Int J Biochem Cell Biol. 2015 Aug;65:169-81. doi: 10.1016/j.biocel.2015.05.025. Epub 2015 May 30. PubMed PMID: 26037596.
İletişim: sanem.avci@ibg.edu.tr
