Dr. Soheil Akbari

Biyografi

Dr. Soheil Akbari, rejeneratif tıp ve insan gelişimi alanında çalışan bir kök hücre ve organoid araştırma uzmanıdır. Üç boyutlu in vitro organoid teknolojileriyle insan organ gelişimini fizyolojik bağlamda modellemekte ve hastalık süreçlerini hücresel düzeyde incelemektedir. scRNA-seq yaklaşımlarını kullanarak karaciğer gelişiminden elde edilen bilgileri daha fizyolojik organoid sistemlerinin geliştirilmesinde kullanmakta; çalışmaları karaciğer hastalıkları ile kornea ve serebral organoid modellerini kapsamaktadır.

Araştırma Alanları

• Organoid Teknolojileri ve 3B İnsan Doku Modellemesi
• Pluripotent Kök Hücre Farklılaşma Mekanizmaları ve Gelişimsel Programlar
• Tek Hücre Düzeyinde Hücresel Kader ve Hücre-Hücre Etkileşim Ağ Analizleri
• Karaciğer Organogenezi, Rejenerasyon ve Hastalık Mekanizmaları
• Nadir ve Metabolik Karaciğer Hastalıklarının Modellemesi 

Yürüttüğü Projeler

Proje Adı:TÜBİTAK 1001 (124Z228) – Karaciğer Organoidi Gelişimini ve Farklılaşmasını Kontrol Eden Hücre-Hücre Etkileşim Ağlarının Aydınlatılması
Proje ekibi:
Yürütücü: Dr. Soheil Akbari
Araştırmacı: Dr. Öğr. Üyesi Necla Kayaalp Koçhan
Danışman: Prof. Dr. Gökhan Karakülah
Süre: 24 Ay
Başlangıç – Bitiş tarihleri: Eylül 2024 – Eylül 2026

Yayınlar

Akbari S, Ersoy N, Bagriyanik A, Arslan N, Önder TT, Erdal E. Generation of Functional Endodermal Hepatic Organoids. J Vis Exp. 2025.

Karabicici M, Akbari S, Caliskan C, Celiker C, Oz O, Binokay L, Karakulah G, Senturk S, Erdal E. Modeling hepatic fibrosis in TP53 knockout iPSC-derived human liver organoids. Mol Oncol. 2025.

Saglam-Metiner P, Devamoglu U, Filiz Y, Akbari S, Beceren G, Goker B, Yaldiz B, Yanasik S, Biray Avci C, Erdal E, Yesil-Celiktas O. Spatio-temporal dynamics enhance cellular diversity, neuronal function and further maturation of human cerebral organoids. Commun Biol. 2023.

Kuruş M, Akbari S, Eskier D, Bursalı A, Ergin K, Erdal E, Karakülah G. Transcriptome Dynamics of Human Neuronal Differentiation From iPSC. Front Cell Dev Biol. 2021.

Akbari S, Sevinç GG, Ersoy N, Basak O, Kaplan K, Sevinç K, Ozel E, Sengun B, Enustun E, Ozcimen B, Bagriyanik A, Arslan N, Önder TT, Erdal E. Robust, Long-Term Culture of Endoderm-Derived Hepatic Organoids for Disease Modeling. Stem Cell Reports. 2019.

Patentler:

Akbari S, Arslan N, Önder TT, Erdal E. Robust, Long-term Culture of Endoderm Derived Hepatic Organoid Technology. Türk Patent No: 2020-16056 (İnceleme aşamasında).

Saglam-Metiner P, Akbari S, Avci CB, Erdal E, Yesil-Celiktas O. Maturation and Industrial Scale Production of Brain Organoids. PCT No: EP23750051.7 (İnceleme aşamasında).

İletişim:  soheil.akbari@ibg.edu.tr