Biyofarmasötik Teknolojiler ve Biyoanaliz

Baş Araştırmacı: Prof. Dr. Hülya AYAR KAYALI

Araştırma grubumuz, hedefe yönelik (targeted) terapi geliştirme alanında çalışmalar yürütmektedir. Yeni ilaç adaylarının belirlenmesi sürecinde moleküler modelleme, docking ve dinamik simülasyon tekniklerini etkin şekilde kullanmaktayız. Monoklonal antikor üretimi ve detaylı karakterizasyonu, projelerimizin temelini oluşturmaktadır. Tanı kitleri geliştirilmesi ve validasyonu üzerine de yoğunlaşmaktayız. Eksozom tabanlı taşıyıcı sistemler ile biyolojik hedeflere hassas ilaç iletimi sağlamayı amaçlıyoruz. Aynı zamanda lipozom ve nanopartikül temelli formülasyonlarla ilaç taşıma sistemleri üzerine çalışmalarımız devam etmektedir. Bu sistemlerin biyouyumluluğu ve etkinliği laboratuvar koşullarında detaylı olarak değerlendirilmektedir. Tüm bu çalışmalar, çok disiplinli bir yaklaşımla yenilikçi tedavi çözümleri sunmayı hedeflemekteyiz.

Araştırma Alanları

Hedefe yönelik (targeted) terapi geliştirme
⁠Yeni ilaç adaylarının geliştirilmesi ve moleküler modelleme (docking & dinamik simülasyonlar)
⁠Monoklonal antikor üretimi ve karakterizasyonu
Tanı Kiti (Diagnostik Kit) geliştirme ve validasyonu
Eksozom tabanlı taşıyıcı sistemler
Lipozom ve nanopartikül formülasyonları ile ilaç taşıma sistemleri
⁠Hedefli ilaç taşıma sistemleri ve biyouyumluluk çalışmaları

Yayınlar

Gungor, Y., Ercan, S., Ermiş, S. S. Ö., Kozalı, Y., Kursunluoglu, G., Sahan, C., ... & Kayali, H. A. NLRP3 is a BMI-independent mediator of stable COPD, BMC Pulmonary Medicine, 25(1), 31, 2025. doi: 10.1186/s12890-024-03435-6

Atalay, E. B., Senturk, S., Ayar Kayalı, H. Wild-type IDH1 Knockout Leads to G0/G1 Arrest, Impairs Cancer Cell Proliferation, Altering Glycolysis, and the TCA Cycle in Colon Cancer. Biochemical Genetics. 1-17, 2023. doi: 10.1007/s10528-022-10325-1

Yilmaz, G., Tavsan, Z., Cagatay, E., Kursunluoglu, G., Ayar Kayalı, H. Exosomes releasedfrom cisplatin-resistant ovarian cancer cells modulate the reprogramming of cells in tumor microenvironments toward the cancerous cells. Biomedicine & Pharmacotherapy. 157, 113973, 2023. doi: 10.1016/j.biopha.2022.113973

Atalay, B. E., Kayalı, A. H. The elevated D-2-hydroxyglutarate level found as a characteristic metabolic change of colon cancer in both in vitro and in vivo models. Biochemical and Biophysical Research Communications. 627, 191-199, 2022. doi : 10.1016/j.bbrc.2022.08.019

Güler S, Kayalı, A. H., Orkun E.,Subaşı E., Half-Sandwich Arene Ruthenium(II) Thiosemicarbazone Complexes: Evaluation of Anticancer Effect on Primary and Metastatic Ovarian Cancer Cell Lines. Frontiers in Pharmacology, 13, 1-15, 2022. doi : 10.3389/fphar.2022.882756

Köse, E., Çağatay, E., MERCAN, T. Y., Kisa, P. T., Güler, S., Gülten, Z. A., ... & Arslan, N. (2022). Could lysosomal acid lipase enzyme activity be used for clinical follow-up in cryptogenic cirrhosis? Turkish Journal of Medical Sciences, 52(4), 1075-1084, 2022. doi: 10.55730/1300-0144.5410

Cagatay, E., Akyildiz, V., Ergun, Y., Kayali, H. A. Synthesis of Murrayaquinone-A Derivatives and Investigation of Potential Anticancer Properties. Chemistry & Biodiversity, e2100348, 2021. doi: 10.1002/cbdv.202100348

Dükel, M., Tavsan, Z., Kayali, H. A. Flavonoids regulate cell death related cellularsignaling via ROS in human colon cancer cells. Process Biochemistry, 101, 11-25,2021. doi: 10.1016/j.procbio.2020.10.002

Tavsan, Z., Kayali, H. A. Protein Kinase C regulates the complex between cell membranemolecules in ovarian cancer. Process Biochemistry, 92, 182-189, 2020. doi: 10.1016/j.procbio.2020.01.009

Tavsan, Z., Ayar Kayalı, H. EpCAM-claudin-tetraspanin-modulated ovarian cancer progression and drug resistance. Cell Adhesion & Migration, 14(1), 57- 68, 2020. doi: 10.1080/19336918.2020.1732761

Subasi, E., Atalay, E. B., Erdogan, D., Sen, B., Pakyapan, B., Kayali, H. A. Synthesis and characterization of thiosemicarbazone-functionalized organoruthenium (II)-arene complexes: Investigation of antitumor characteristics in colorectal cancer cell lines. Materials Science and Engineering: C, 110152, 2020. doi: 10.1016/j.msec.2019.110152

Projeler

TÜSEB, Ovaryum Kanseri için Protein Kinaz C Alfa (PKC) ve Matriks Metallop roteinaz (MMP) Hedefli Terapötik Stratejilerin Araştırılması

TÜBİTAK, SEPSİS için hızlı tanı kiti geliştirilmesi (Tamamlandı)

TÜBİTAK, glikan kitinin geliştirilmesi ve validasyonu (Tamamlandı)

BAP, Rekombinant LAsparaginaz Üretimi (Recombinant) L- Asparaginase production) (Tamamlandı) 

ADEP, Laktat Tayini için Lateral Flow Temelli Hızlı Tanı Kiti Geliştirilmesi (Tamamlandı)

TÜSEB, Ovaryum Kanserine Yönelik Yeni Nesil Terapötik Antikor- İlaç Konjugatı Sentezi ve Karakterizasyonu (Tamamlandı)

TÜSEB, Yumurtalık Kanserinde Etkili Biyobenzer İlaçların Geliştirilmesi (Tamamlandı)

TÜBİTAK (1007), Kanser ve Osteoporoz Tedavisi İçin Monoklonal Antikor Etkin Maddeli Biyobenzer İlaç Geliştirilmesi ve Üretilmesi (Tamamlandı)

TÜBİTAK (1001), Ovaryum Kanser Hücrelerinden Salınan Eksozomların Primer Ovaryum Kanser Hücreleri ile Sağlıklı Epitel ve Mezotel Hücreler Tarafından Alınım Yolları ve Hedef Hücrelerdeki Karsinojenez Mekanizmasına Etkisi (Tamamlandı)

TÜBİTAK (1002), TCA Döngüsü ve Glikoliz Yolağındaki Metabolit Seviyelerinin Farklı Asamalardaki Kolon Kanseri Hücre Hatlarında HPLC Yöntemi ile Incelenmesi, (Tamamlandı)

BAP, Kolon Kanserinde Etkin Bazı Yolaklar Üzerine PKC İzoenzim Aktivitelerinin Etkisinin in vitro İncelenmesi (Tamamlandı)

TÜBİTAK (1001), Ovaryum Kanserinde Tetraspanin- claudin- epcam Tümör Belirleyici Proteinlerinin ve Protein Kinaz C'nin Rolünün Belirlenmesi (Tamamlandı)

BAP, Derin Kültür Fermentasyonu ile Ramoplanin Antibiyotiğinin Üretimi (Tamamlandı)

BAP, Ökaryotik Kanser Modelin de Bazı Tümör Belirteçlerinin ve Protein Kinaz C nin Diferansiyel Rolü (Tamamlandı)

BAP, Bazı Çevresel Faktörlerin Türkiye'de Yetişen Tıbbi Bitkilerin Sekonder Metabolit Üretimine Etkisinin İncelenmesi (Tamamlandı)

BAP, Kemoterapide Kullanılan Cisplatin’in Glia Hücrelerinin Elektron Transport Sistemi Üzerine Etkisinin Araştırılması (Tamamlandı)

BAP, Amycolatopsis orientalisde vankomisin antibiyotik üretimi ile pentoz fosfat yolu çevrimi metabolitleri arasındaki korelasyonun belirlenmesi (Tamamlandı)

Patentler

Kolon kanseri tedavisinde kullanılmak üzere bir α-ketoglutar at inhibitörü, Patent, Bölüm A İnsan İhtiyaçları, 2022/018034

Spesifik olarak yumurtalık kanseri hücreleri üzerinde sitotoksik etkiye sahip polimerik nanopartikül ve bunu hazırlama yöntemi, 2023/004757

Polymeric nanoparticle that has a cytotoxic effect specifically on ovarian cancer cells and a method of preparing it., PCT/TR2024/050241

VEGFR-2 targeted antibody-drug conjugate effective in the treatment of ovarian cancer (Patent No. WO2025136325)

Ekip

Aktif Üyeler

Ekrem Tınaz (Araştırmacı)
Gizem Yılmazer Altun (Ar-Ge Personeli)
Duygu Erdoğan (Doktora Sonrası Araştırmacı)
Elçin Çağatay (Doktora Sonrası Araştırmacı)
Yonca Güngör (Doktora Öğrencisi)
Ege Gökçe Savaş (Doktora Öğrencisi)
Mariam J. M Ghunaım (Doktora Öğrencisi)
Aytaj Abushova (Doktora Öğrencisi)
Fethican Kayhan (Doktora Öğrencisi)
Ezgi İtil (Doktora Öğrencisi)
Defne Gövem (Yüksek Lisans Öğrencisi)
Onur Özkaya (Yüksek Lisans Öğrencisi)
Halit Enes Belge (Yüksek Lisans Öğrencisi)
Hilal Tay (Yüksek Lisans Öğrencisi)

Önceki Üyeler

Gizem Kurşunoğlu (Araştırmacı)
İlyas Umur Ayaz (Araştırmacı)
Muzaffer Dükel (Misafir Araştırmacı)
Gaye Saygı (Misafir Araştırmacı)
Zehra Tavşan (Doktora Sonrası Araştırmacı)
Seminay Güler (Doktora Öğrencisi)
Egemen Erdem Güler (Doktora Öğrencisi)
Esra Bulut (Doktora Öğrencisi)
Pumla Bhekıwe Manyatsı (Doktora Öğrencisi)
Gülnur Çırak (Yüksek Lisans Öğrencisi)
Gizem Yılmaz (Yüksek Lisans Öğrencisi)
Aziz Umut Durak (Yüksek Lisans Öğrencisi)
Ayşe Caşkır (Yüksek Lisans Öğrencisi)
Yiğit Kozalı (Yüksek Lisans Öğrencisi)
Buse Sevgi (Yüksek Lisans Öğrencisi)
İlayda Keleş (Yüksek Lisans Öğrencisi)