Omics Teknolojilerine Giriş: Metagenomik
Omics Teknolojilerine Giriş: Metagenomik
04-05.12.2026
İzmir Biyotıp ve Genom Merkezi (İBG) Biyoinformatik Hizmet Birimi tarafından 04-05 Aralık tarihlerinde “Omics Teknolojilerine Giriş: Metagenomik” başlıklı 2 günlük uygulamalı eğitim programı düzenlenecektir.
Bu eğitim programı kapsamında katılımcılar, yeni nesil dizileme (NGS) teknolojilerinin temel prensiplerini öğrenerek bakteri, mantar ve virüs gibi mikroorganizmalardan oluşan toplulukları (mikrobiyota) inceleyen metagenomik verilerin analiz süreçlerini hem teorik hem de uygulamalı olarak deneyimleme fırsatı bulacaktır.
Başlangıç seviyesinde tasarlanan eğitimde, ham dizileme verilerinin kalite kontrolünden taksonomik sınıflandırmaya, mikrobiyal çeşitlilik ve diferansiyel bolluk analizlerinden sonuçların biyolojik olarak yorumlanmasına kadar uzanan temel biyoinformatik analiz süreçleri adım adım ele alınacaktır.
Eğitime katılım için önceden kodlama veya biyoinformatik deneyimi gerekmemektedir.
Eğitim İçeriği
Eğitim boyunca teorik anlatımlar uygulamalı oturumlarla desteklenecek, katılımcıların temel metagenomik analiz süreçlerini kavramaları ve uygulayabilmeleri hedeflenecektir.
Metagenomik analiz adım adım
Bir biyolojik soruyla başlar, laboratuvarda numuneden dizileme verisi üretilir, bu veri bilgisayarda işlenip analiz edilir ve sonunda soruya bir cevap çıkar. Aşağıdaki şema bu yolculuğun 11 adımını, her adımda ne yapıldığını, hangi aracın kullanıldığını ve neyin elde edildiğini gösterir. Sağ üstteki etiketler adımın kursta hangi oturumda işlendiğini belirtir.
1. Gün – Metagenomik: Biyolojiden Veriye
|
Saat |
Tür |
Oturum |
|
09:30–09:45 |
Açılış |
Tanışma |
|
09:45–10:30 |
Teori |
T1. Omics teknolojileri ve metagenomik |
|
10:30–11:00 |
Pratik |
P1. Örnek bir metagenomik çalışması |
|
11:00–11:15 |
Ara |
Kahve arası |
|
11:15–12:00 |
Teori |
T2. Metagenomik laboratuvar adımları ve deney tasarımı |
|
12:00–12:30 |
Pratik |
P2. Deney tasarımı uygulaması |
|
12:30–13:30 |
Ara |
Öğle arası |
|
13:30–14:10 |
Teori |
T3. Dizileme verisi ve Linux |
|
14:10–15:00 |
Pratik |
P3. Kalite kontrol uygulaması |
|
15:00–15:15 |
Ara |
Kahve arası |
|
15:15–15:50 |
Teori |
T4. Okuma işleme ve taksonomik sınıflandırma |
|
15:50–16:20 |
Pratik |
P4. Taksonomik sınıflandırma uygulaması |
|
16:20–17:00 |
Kapanış |
Günün özeti |
2. Gün – Metagenomik: Veriden Biyolojik Anlama
|
Saat |
Tür |
Oturum |
|
|
09:30–09:45 |
Açılış |
1. günün tekrarı |
|
|
09:45–10:15 |
Teori |
T5. R'a giriş |
|
|
10:15–11:00 |
Pratik |
P5. R ve RStudio uygulaması |
|
|
11:00–11:15 |
Ara |
Kahve arası |
|
|
11:15–11:45 |
Teori |
T6. Mikrobiyal kompozisyon ve çeşitlilik analizi |
|
|
11:45–12:30 |
Pratik |
P6. Çeşitlilik analizi uygulaması |
|
|
12:30–13:30 |
Ara |
Öğle arası |
|
|
13:30–14:00 |
Teori |
T7. Diferansiyel bolluk analizi |
|
|
14:00–14:45 |
Pratik |
P7. Diferansiyel bolluk uygulaması |
|
|
14:45–15:00 |
Ara |
Kahve arası |
|
|
15:00–15:30 |
Teori |
T8. Fonksiyonel metagenomik analiz |
|
|
15:30–16:05 |
Pratik |
P8. Fonksiyonel analiz uygulaması |
|
|
16:05–17:00 |
Kapanış |
Kapanış ve değerlendirme |
|
Kimler Katılabilir?
Eğitim; biyoloji, moleküler biyoloji ve genetik, mikrobiyoloji, tıp, ziraat, veterinerlik, gıda ve çevre bilimleri ile ilgili alanlarda eğitim gören lisans/lisansüstü öğrencileri, akademisyenler ve araştırmacılara yöneliktir.
Program başlangıç seviyesinde olup önceden programlama veya biyoinformatik bilgisi gerektirmemektedir.
Kurs Bilgileri
- Tarih: 04-05 Aralık
- Yer: İzmir Biyotıp ve Genom Merkezi (İBG), 3002 No'lu Salon
- Format: Yüz yüze ve çevrim içi (canlı yayın)
- Kontenjan: Yüz yüze 20 kişi, çevrim içi 20 kişi
- Son kayıt tarihi: 19 Kasım
- Son ödeme tarihi: 26 Kasım
Kurs Ücretleri
|
Katılımcı Grubu |
Yüz Yüze |
Çevrim İçi |
|
Lisans / Lisansüstü Öğrenci |
5.500 TL |
3.500 TL |
|
Akademisyen |
6.500 TL |
4.250 TL |
|
Sanayi / Özel Sektör |
7.500 TL |
5.000 TL |
Yüz yüze katılımcıların, uygulamalı oturumlara aktif katılım sağlayabilmeleri için kendi dizüstü bilgisayarlarını getirmeleri gerekmektedir.
Başvuru Linki: https://forms.gle/NoYjWQUuzB4MqiR48
İletişim:leman.binokay@ibg.edu.tr
