Akış Sitometrisi ve Hücre Ayrımlama Birimi

Akış sitometrisi, hücrelerin fiziksel ve/veya kimyasal özelliklerinin tek hücre düzeyinde, eş zamanlı ve çok parametreli olarak analiz edilmesine olanak sağlayan lazer tabanlı ileri bir analitik teknolojidir. Süspansiyon halindeki hücreler, akış sistemi içerisinde tek hücre olacak şekilde hizalanarak farklı dalga boylarındaki lazerler aracılığıyla analiz edilir. Hücre boyutu, granüler yapısı, saçılan ışık özellikleri ve bağıl floresan yoğunluğu gibi parametrelere ait sinyaller, optik filtrelerden geçirildikten sonra ışık dedektörleri tarafından algılanır. Elde edilen veriler dijital elektronik sinyallere dönüştürülerek özel yazılımlar aracılığıyla ileri analizler için kaydedilir.

Akış sitometri alanında uzmanlaşmış teknik ekibimiz ve yıllara dayanan deneyimimiz ile araştırma projelerinize uluslararası standartlarda, güvenilir ve yüksek kaliteli hizmet sunulmaktadır.

Cihazlar

• BD FACSAria III – Hücre Ayrımlama (Sorting)

• BD LSRFortessa – Hücre Analizi

• BD FACSCanto II – Hücre Analizi

Sunduğumuz Analitik Hizmetler

• Çok renkli (multicolor) analizler

• Memeli canlı kaynaklı hücrelerde fenotipleme

• Patojen olmayan bakteri ve mayalarda canlılık ve protein ekspresyonu analizleri

• Hücre içi sinyal iletim yolaklarının analizi

• Hücresel aktivasyon durumları ve oksidatif patlama ölçümleri

• Hücre canlılığı, apoptoz ve proliferasyon analizleri

• Mitokondriyal membran potansiyeli analizleri

• DNA içeriği, poliploidi tespiti ve hücre döngüsü analizleri

• Gen ekspresyonu ve gen transferi (örneğin transfeksiyon verimliliği) değerlendirmeleri

• Hücre içi kalsiyum akışı ölçümleri

• Yüzey ve hücre içi belirteçlerin (örneğin hücre içi sitokin düzeyleri) eş zamanlı analizi

Sunduğumuz Ayrımlama (Sorting) Hizmetleri

• Toplu (bulk) hücre ayrımlama

• Eş zamanlı olarak 4 farklı hücre popülasyonuna kadar ayrımlama

• Tek Hücre Ayrımlama (Single-Cell Sorting): 96 ve 384 kuyucuklu plakalar gibi formatlara tek tek hücre ayırabilme

• Örnekte bulunan hedef hücre popülasyonlarının yüksek saflık ve hassasiyetle ayrımlanması

• Hücre boyutuna uygun olarak 70 µm, 85 µm, 100 µm ve 130 µm nozul seçenekleri ile ayrımlama

Akış Sitometrisi ile İlgili Yayınlar

1.Yılmaz A, Özbilgiç R, Polatlı E, Erbay İH, Sağ D, Güven S.: Macrophage Polarization Profiling in Dynamic Culture System. Cel. Mol. Bioeng. (2025).  https://doi.org/10.1007/s12195-025-00863-0

2. Alperen Yılmaz, Resul Özbilgiç, Elifsu Polatlı, İbrahim Halilullah Erbay, Duygu Sağ &  Sinan Güven: Development of a mouse embryonic stem cell model for investigating the functions of the linker histone H1-4  https://doi.org/10.1002/2211-5463.13750

3. Eskiocak YC, Ayyildiz ZO, Gunlap S, Korkmaz A, Sag D, Wingender G: The Ca2+ concentration impacts the cytokine production of mouse and human lymphoid cells and the polarization of human macrophages in vitro2023 https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/36827279/

4. Ozkan M, Eskiocak YC, Wingender G: Macrophage and dendritic cell subset composition can distinguish endotypes in adjuvant-induced asthma mouse models https://journals.plos.org/plosone/article?id=10.1371/journal.pone.0250533

5. Ozkan M, Eskiocak YC, Wingender G: The IL-10GFP (VeRT-X) mouse strain is not suitable for the detection of IL-10 production by granulocytes during lung inflammation. https://doi.org/10.1371/journal.pone.0247895

6. Sag D, Ozkan M, Kronenberg M and Wingender G: Improved Detection of Cytokines Produced by Invariant NKT Cells

https://www.nature.com/articles/s41598-017-16832-1

7.Soheil Akbari, GülbenGürhan Sevinç, Nevin Ersoy, Onur Basak, Kubra Kaplan, Kenan Sevinç,Erkin Ozel, Berke Sengun, Eray Enustun, Burcu Ozcimen, Alper Bagriyanik , Nur Arslan , Tamer Tevfik Önder , Esra Erdal: Robust, Long-Term Culture of Endoderm-Derived Hepatic Organoids for DiseaseModeling

https://doi.org/10.1016/j.stemcr.2019.08.007

8. Pelin Saglam-Metiner, Utku Devamoglu, Yagmur Filiz, Soheil Akbari, Goze Beceren, Bakiye Goker, Burcu Yaldiz, Sena Yanasik, Cigir Biray Avci, Esra Erdal & Ozlem Yesil-Celiktas: Spatio-temporal dynamics enhance cellular diversity, neuronal function and further maturation of human cerebral organoids  https://.nature.com/articles/s42003-023-04547-1.pdf?

9. Zeynep Firtina Karagonlar, Soheil Akbari, Mustafa Karabicici, Eren Sahin, Sanem Tercan Avci, Nevin Ersoy, Kıvılcım Eren Ates, Tugsan Balli, Bilge Karacicek, Kubra Nur Kaplan, Canan Celiker, Nese Atabey, Esra Erdal: A Novel Function for KLF4 in Modulating the De-Differentiation of EpCAM−/CD133− nonStem Cells into EpCAM+/CD133+ Liver Cancer Stem Cells in HCC Cell Line HuH7 https://doi.org/10.3390/cells9051198

10. Mustafa Karabicici, Soheil Akbari, Ceyda Caliskan, Canan Celiker, Ozden Oz, Leman Binokay, Gökhan Karakulah, Serif Senturk, Esra Erdal: Modeling hepatic fibrosis in TP53 knockout iPSC-derived human liver organoids https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/41065540/

11. Pelin Saglam-Metiner, Elif Duran, Leila Sabour-Takanlou, Cigir Biray-Avci, Ozlem Yesil-Celiktas: Differentiation of Neurons, Astrocytes, Oligodendrocytes and Microglia From Human Induced Pluripotent Stem Cells to Form Neural Tissue-On-Chip: A Neuroinflammation Model to Evaluate the Therapeutic Potential of Extracellular Vesicles Derived from Mesenchymal Stem Cells https://link.springer.com/article/10.1007/s12015-023-10645-8#Sec24

12. Pelin Saglam-Metiner, Utku Devamoglu, Yagmur Filiz, Soheil Akbari, Goze Beceren, Bakiye Goker, Burcu Yaldiz, Sena Yanasik, Cigir Biray Avci, Esra Erdal & Ozlem Yesil-Celiktas: Spatio-temporal dynamics enhance cellular diversity, neuronal function and further maturation of human cerebral organoids https://www.nature.com/articles/s42003-023-04547-1

13. Unuvar Purcu, D., Korkmaz, A., Gunalp, S., Helvaci, D. G., Erdal, Y., Dogan, Y., Suner, A., Wingender, G., Sag, D. (2022).  Effect of stimulation time on theexpression of human macrophage polarization markers. https://doi.org/10.1371/journal.pone.0265196

14. Gunalp, S., Helvaci, D. G., Oner, A., Bursalı, A., Conforte, A., Güner, H., Karakülah, G., Szegezdi, E., & Sag, D. (2023). TRAIL promotes the polarization of human macrophages toward a proinflammatory M1 phenotype and is associated with increased survival in cancer patients with high tumor macrophage content. Frontiers in Immunology, 14, 1209249. https://doi.org/10.3389/fimmu.2023.1209249

15. Korkmaz, A., Unuvar, D., Gunalp, S., Helvaci, D. G., & Sag, D.: Kabasura kudineer choornam, a medicinal polyherbal formulation, modulates human macrophage polarization and phagocytic function. Turkish Journal of Biology, 49(4), 348–366. https://doi.org/10.55730/1300-0152.2752

16. Eda Argitekin Esra Ersoz-GulsevenGulcin Cakan-AkdoganYasar Akdogan: Dopamine-Conjugated Bovine Serum Albumin Nanoparticles Containing pH-Responsive Catechol-V(III) Coordination for In Vitro and In Vivo Drug Delivery https://pubs.acs.org/doi/10.1021/acs.biomac.3c00363?hl=tr-TR

17. Aysegul Kaymak Ozdemir and Mahinur Basci: Elucidating the role of ZRF1 in monocyte-to-macrophage differentiation, cell proliferation and cell cycle in THP-1 cells https://www.degruyterbrill.com/document/doi/10.1515/tjb-2024-

Araştırmacılar / Uzman Araştırmacılar

Birim Sorumlusu: 

Rezervasyon