Fonksiyonel Kanser Genomik

Baş Araştırmacı: Prof. Dr. Şerif ŞENTÜRK

Şentürk Fonksiyonel Kanser Genomik Laboratuvarı, kanser biyolojisinde işlevsel genetik yaklaşımlar kullanarak kanserin temel mekanizmalarını anlamayı hedeflemektedir. CRISPR/Cas9 teknolojisine dayalı genetik taramalar, genom düzenleme ve hedef doğrulama stratejileriyle, kanser hücrelerinin sağkalımı, agresif fenotipleri ve tedavi direnci gibi süreçlerini yöneten genetik ve epigenetik ağlar araştırılmaktadır. Hücre temelli işlevsel deneylerin yanı sıra organoid ve hayvan modelleri gibi ileri düzey model sistemler de çalışmalarımıza entegre edilmektedir. Bu çalışmalar, yeni tedavi hedeflerinin tanımlanması ve kişiye özel tıbbın geliştirilmesine katkı sağlamayı amaçlamaktadır. Laboratuvarımız, disiplinler arası iş birliklerine açık bir ortamda, yenilikçi araştırma projeleri geliştirmektedir.

Araştırma Alanları

• Fonksiyonel Genomik
• CRISPR/Cas9 Genom Düzenleme
• Organoid ve Hayvan Modelleri
• Kanser Biyolojisi ve Tedavi Direnci
• Genom Kararlılığı ve Tümör Baskılayıcı Yollar

Yayınlar

Dayanc B, Eris S, Gulfirat NE, Ozden-Yilmaz G, Cakiroglu E, Coskun Deniz OS, Karakülah G, Erkek-Ozhan S, Senturk S. Integrative multi-omics identifies AP-1 transcription factor as a targetable mediator of acquired osimertinib resistance in non-small cell lung cancer. Cell Death & Disease. 2025 May 25;16(1):1-7. doi: 10.1038/s41419-025-07711-z.

Guler Kara H, Dogan E, Bozok V, Aktan C, Cakiroglu E, Eroglu Z, Aygunes Jafari D, Korkmaz KS, Senturk S, Kosova B. The G protein‐coupled receptor GPR 89 A is a novel potential therapeutic target to overcome cisplatin resistance in NSCLC Calu1 cells. The FEBS Journal. 2025 Apr 21. doi: 10.1111/febs.70099.

Cakiroglu E, Eris S, Oz O, Karakülah G, Senturk S. Genome-wide CRISPR screen identifies BUB1 kinase as a druggable vulnerability in malignant pleural mesothelioma. Cell Death & Disease. 2025 Apr 3;16(1):241. doi:10.1038/s41419-025-07587-z.

Kalyoncu M, Demirci D, Eris S, Dayanc B, Cakiroglu E, Basol M, Uysal M, Cakan-Akdogan G, Liu F, Ozturk M, Karakülah G, Senturk S. Escape from TGF-β-induced senescence promotes aggressive hallmarks in epithelial hepatocellular carcinoma cells. Mol Oncol. 2025 Mar 14. doi:10.1002/1878-0261.70021.

Akdemir B, Gungor MZ, Senturk S. RUVBL1/2 Complex in Cancer: Emerging Mechanisms and Therapeutic Opportunities, Interdisciplinary Cancer Research (pp.1-24), Londrina: Springer, Cham.

Projeler

TÜBİTAK 2247-A: Organoid Tabanlı Mesane Kanseri Preklinik Platformunun Geliştirilmesi ve Potansiyel Yeni Bir Terapötik Hedef Olarak RUVBL1/2 Kompleksi’nin Değerlendirilmesi (Yürürlükte)

DEÜ-BAP-ADEP: Mesane Kanserinde Epiregülomu Hedeflemenin Terapötik Potansiyeli: Organoid Modelinde Epigenetik İlaç Taraması ve Moleküler Çıkarımlar (Yürürlükte)

DEÜ-BAP-ADEP: Malign Plevral Mezotelyoma Çip-Üstü-Tümöroid Modelinin Translasyonel ve Preklinik Etkinliğinin BUB1 ve RUVBL1 İnhibisyonu Ekseninde Araştırılması (Yürürlükte)

TÜBİTAK-1001: Mesane Kanserinde RUVBL1/2 Kompleksinin Rolü: Hücresel ve Moleküler Mekanizmalar ve Terapötik Etkileri (Yürürlükte)

TÜBİTAK-1001: Küçük Hücreli Dışı Akciğer Kanseri Tedavisinde Osimertinib Direnci: FOSL1 ve JUN Transkripsiyon Faktörlerinin Rolü ve Sentetik Letal Etkileşimleri (Yürürlükte)

TÜSEB: Malign Plevral Mezotelyoma'da BUB1 Geninin Moleküler Rolünün Araştırılması (Tamamalandı)>TÜBİTAK-1002: RUVBL1 Geninin Malign Plevral Mezotelyomadaki Moleküler Rolünün İncelenmesi (Tamamlandı)
DEÜ-BAP: Uzun Süreli Stabil CHO-DG44 Hücre Kültürlerinde Konstitütif Promotörlerin Sistematik Karşılaştırılması (Tamamalandı)

TÜBİTAK-2501 NSF: EGFR-mutant Küçük Hücreli Dışı Akciğer Kanseri’nde Birinci Basamak Osimertinib Tedavisinde Gelişen Edinsel Dirençte Epigenetik ve Transkripsiyonel Faktörlerin Rolünün Araştırılması (Tamamlandı)

TÜBİTAK-3001: Hepatoselüler Kanserde TGF-β Tarafından İndüklenen Senesans Karşıtı Direnç Mekanizmalarının Tüm Genom Transkriptom Analizi ile Araştırılması (Tamamalandı)>TÜBİTAK-3501: Malign Plevral Mezotelyoma Gelişiminde Rol Oynayan Esansiyel Genlerin ve Hücresel Yolakların CRISPR/Cas9 Güdümlü Tüm Genom Negatif Seçilim Tarama Yöntemiyle Sistematik Olarak Sorgulanması, Aydınlatılması ve Moleküler Karakterizasyonu (Tamamlandı)

Ekip

Aktif Üyeler

Dr. Ece Çakıroğlu (Doktora Sonrası Araştırmacı)

Dr. FazelGorjipour (Doktora Sonrası Araştırmacı)

MSc. Sude Eriş (Doktora Öğrencisi)

MSc. Nazlıcan Kaygusuz (Doktora Öğrencisi)

MSc. Serra Şener (Doktora Öğrencisi)

Buse Akdemir (Yüksek Lisans Öğrencisi)

Nazife Ege Gülfırat (Yüksek Lisans Öğrencisi)

Ebru Kırmızıay (Yüksek Lisans Öğrencisi)

Tunç Ünal (Master Öğrencisi)

Minenur Öztürk (Araştırmacı)

Önceki Üyeler

Nur Bozbey (2023-2024) (Ziyaretçi Araştırmacı)

Deniz Ulaş Öztürk (February-August 2024) (TUBITAK STAR Bursiyeri)

Melikşah Dündar (February-August 2024)  (TUBITAK STAR Bursiyeri)

Sude Eriş (2021-2024) (Master Öğrencisi)

Ahmet Yılmaz Asil (September-December 2024)- (TUBITAK STAR Bursiyeri)

Esat Gençtürk (September-December 2024)- (TUBITAK STAR Bursiyeri)

Ali Can Kurtul (September-December 2024)- (TUBITAK STAR Bursiyeri)

Bengisu Uluata Dayanç (2019-2025) - (Doktora Öğrencisi)

Deniz Onan (January-August 2024) - (Ziyaretçi Araştırmacı)

Ayşenaz Akkaya (2022-2025)- (MD-PhD)