Kök Hücre ve Organoid Teknolojileri

Baş Araştırmacı: Prof. Dr. Esra ERDAL

Kök Hücre ve Organoid Teknolojileri Laboratuvarı, insan pluripotent kök hücrelerinden türetilen karaciğer ve beyin organoidleri geliştirerek, hastalık fenotipini yüksek doğrulukla taklit edebilen in vitro hastalık modelleri oluşturmayı hedeflemektedir. Bu modeller, özellikle preklinik aşamada ilaç etkinliği ve güvenilirliğinin değerlendirilmesi için kullanılmaktadır.

Son yıllarda laboratuvarımızda geliştirilen endodermal hepatik organoid (eHEPO) teknolojisi ile, karaciğerin metabolik nadir hastalıklarını taklit eden özgün modeller üretilmiştir. eHEPO platformunun, ilaç geliştirme sürecinin kritik bir basamağı olan hepatotoksisite testlerinde, hayvan modellerine etik ve bilimsel açıdan güçlü bir alternatif olarak kullanılması hedeflenmektedir.

Bunlara ek olarak, özellikle karaciğer kanseri başta olmak üzere farklı kanser türlerinde; kanser kök hücre biyolojisi, tümör başlama mekanizmaları ve tümör mikroçevresinin rolünü anlamaya yönelik hem kanser hücre hatları hem de hayvan modelleri ile yürütülen temel araştırmalar, laboratuvarımızın önemli bilimsel çıktılarını oluşturmaktadır.

Araştırma Alanları

Nadir Hastalık
Kanser
Organoid ve kök hücre kaynaklı hastalık modellerinin geliştirilmesi
Kanser kök hücre
Hepatotoksisite

Yayınlar

Karabicici M., Akbari S, Caliskan C, Celiker C, Oz O, Binokay L, Karakulah G, Senturk S, Erdal E. “Modeling Hepatic Fibrosis in TP53 Knockout iPSC-Derived Human Liver Organoids,” Mol. Cancer 2025 (Kabul edildi)
Akbari, S., Ersoy, N., Bagriyanik, A., Arslan, N., Önder, T. T., Erdal, E. Generation of Functional Endodermal Hepatic Organoids. J. Vis. Exp. (219), e65027, 2025
Karabicici M., Akbari S., Gumustekin M., Erdal E. "Human liver organoid models for assessment of drug toxicity at the preclinical stage" Endocrine Metabolic & Immune Disorders – Drug Targets 2023 Apr 11.
Saglam-Metiner P., Devamoglu U , Filiz Y., Akbari S., Beceren G., Bagca G., Yaldiz B., Yanasik S., Biray Avci C., Erdal E., Yesil Celiktas O. "Spatio-temporal dynamics enhance cellular diversity, neuronal function and further maturation of human cerebral organoids" Communications Biology 6, 173 (2023).
Akbari S, Gurhan Sevinc G, Ersoy N, Basak O, Kaplan K, Sevinc K, Ozel E, Sengun B, Enustun E, Ozcimen B, Bagriyanik A, Arslan N, Onder T, Erdal E. Robust, long-term culture of endoderm derived hepatic organoids for disease modeling. Stem Cell Reports 2019 Oct 8;13(4):627-641

Projeler

E.Erdal’ın yürütücü olduğu projeler

Tübitak-Italya ikili İş birliği- 124N833- EXploring therapeutic strategies for cblC Disease: Italy-Turkey collaboration (Devam ediyor)

Tübitak-1001- 221S447- Hepatik Organoidlerde, Kültür Mikroçevre Modifikasyonlarının, Fonksiyon ve Matürasyona Etkilerinin Tek Hücre Seviyesinde İncelenmesi (Devam ediyor)

Tübitak-1001- 124R024- "Çip-Üstü-Karaciğer Organoid Modelinde Karaciğer Dokusundaki Zonasyonunun Oluşturulması Ve Fonksiyonel Karakterizasyonu" (Devam ediyor)

TUSEB-B-ArGe- 35887-İnsan Karaciğer Fibroz Organoid Modelinin Hücresel Karakterizasyonu ve p53 ile Düzenlenen Hücre Dışı Matriks Değişikliklerine Yönelik Mekanizmaların Belirlenmesi (Devam ediyor)

S. Akbari’nın yürütücü olduğu projeler

Tübitak-1001- 124Z228- Karaciğer Organoidi Gelişimini ve Farklılaşmasını Kontrol Eden Hücre-Hücre Etkileşim Ağlarının Aydınlatılması

Patent

Türk-Patent-2020-16056 ve Amerika- 18/247,651 numaralı- Robust, long-term culture of endoderm derived hepatic organoid technology (İnceleme aşamasında)

Ekip

Aktif Üyeler

...

Önceki Üyeler

İmge Kunter

Sanem Tercan Avcı

Kübra Aslan

Zeynep Fırtına

Ceyda Çalışkan

Mustafa Karabiçici